研究人员发现SARS-CoV-2病毒“高度适应人类”
导读:科学家们利用计算机建模来研究SARS-CoV-2(引起COVID-19大流行的病毒),发现该病毒最适宜感染人类细胞。
科学家们利用计算机建模来研究SARS-CoV-2(引起COVID-19大流行的病毒),发现该病毒最适宜感染人类细胞。在《自然》杂志《科学报告》上发表的一篇论文中,澳大利亚科学家描述了他们如何利用SARS-CoV-2病毒在大流行之初的形态,加上高性能计算机模型来预测其感染人类和一系列12种家畜和野生动物的能力。
"人类显示出最强的尖峰结合,与对病毒的高易感性相一致。"- 拉筹伯大学David Winkler教授他们的工作旨在帮助确定任何可能在向人类传播病毒方面发挥作用的中间动物媒介,并了解猫和狗等伴侣动物以及牛、羊、猪和马等常见家畜的敏感性所带来的任何风险。
来自弗林德斯大学和拉筹伯大学的科学家们利用12种动物的基因组数据,为每个物种的关键ACE2蛋白受体建立计算机模型。这些模型随后被用来计算SARS-CoV-2尖峰蛋白与每个物种的ACE2受体的结合强度。
令人惊讶的是,结果显示SARS-CoV-2与人类细胞上的ACE2结合的强度超过了任何一个被测试的动物物种,包括蝙蝠和袋鼠。
弗林德斯大学的Nikolai Petrovsky教授
拉筹伯大学教授David Winkler说:"人类显示出最强的穗状结合,与对病毒的高易感性相一致。"
这些发现最初发布在ArXiv预印本服务器上,现在已被同行评审并发表在《科学报告》(Springer Nature)上。
该团队的计算机模型显示,SARS-CoV-2病毒也与来自穿山甲的ACE2有相对强烈的结合,穿山甲是一种罕见的野生食蚁动物,在东南亚的一些地方被发现,偶尔会被用作食物或传统药物。Winkler教授说,在该研究调查的所有除了人以外的动物中,穿山甲显示出最高的穗状结合能力,明显高于蝙蝠、猴子和蛇。
在大流行的早期,一些科学家错误地认为他们在穿山甲中发现了SARS-CoV-2,但这种说法迅速被收回,因为他们描述的穿山甲冠状病毒与SARS-CoV-2的基因相似度不到90%。然而,这项研究和其他研究表明,穿山甲冠状病毒穗状蛋白中与ACE2结合的特定部分与SARS-CoV-2的穗状蛋白几乎相同。
澳大利亚拉筹伯大学的David Winkler教授
这种共享几乎相同的穗状蛋白几乎可以解释为什么SARS-CoV-2与穿山甲ACE2结合得如此好。彼得罗夫斯基教授说:"穿山甲和SARS-CoV-2尖峰蛋白可能是通过某种方式(聚合进化、病毒间的基因重组等)进化出相似之处,但目前没有办法区分这些可能性。"
"总的来说,抛开耐人寻味的穿山甲ACE2结果,我们的研究表明,COVID-19病毒非常适应于感染人类。我们还推断,一些被驯化的动物,如猫、狗和牛,也可能对SARS-CoV-2的感染很敏感,"Winkler教授补充说。
研究人员总结说,SARS-CoV-2病毒如何以及在哪里适应成为如此有效的人类病原体仍然是一个谜,他们补充说,找到该疾病的起源将有助于保护人类免受未来冠状病毒大流行的影响。
相关文献:
https://doi.org/10.1038/s41598-021-92388-5