科学家利用海绵更容易地检测水生环境的eDNA
来源:cnBeta.COM 发布时间: 2019-06-05 13:23:22 编辑:Emily
导读:最近有研究指出科学家可以通过检测动物定期丢到水环境中的DNA来判断水生环境中存在哪些生物。
最近有研究指出科学家可以通过检测动物定期丢到水环境中的DNA来判断水生环境中存在哪些生物。一项新的研究表明,由于天然DNA捕获“能手”海绵,这种做法可能很快就会变得更容易。
目前,研究人员必须过滤大量的水,以便找到动物在蜕皮或排便时排出的稀释的“环境DNA”(或eDNA)。根据英国索尔福德大学海洋生态学家Stefano Mariani的说法,这种做法涉及多项工作,而且结果可能会受到过滤设备中存在的异地DNA污染的影响。此外,储存的水样中的DNA可能会在处理这些样品之前降解。
考虑到这一点,他反而关注已经在海洋和淡水环境中生长的海绵。据报道,这些生物每天可过滤多达10000升的水,并在其组织中捕获eDNA。
当Mariani和他的团队分析了在南极和地中海聚集的海绵样本时,他们发现了31个分类群的DNA 。这些物种主要是鱼类,尽管来自南极洲的一个海绵样本含有威德尔海豹和帽带企鹅的DNA - 然而这主要是因为该样本聚集在企鹅繁殖地附近。
此外,为了避免来自宿主材料的干扰,科学家利用DNA引物(一种短核酸序列)扩增脊椎动物的DNA,但对海绵本身的DNA没有影响。
“海绵是理想的采样单位,因为你可以在任何地方和每个水生栖息地找到它们,”Mariani说道。“此外,它们不是非常有选择性的过滤器,它们不会逃跑,它们不会受到采样的伤害 - 你可以抓住一块,它们将能很好地再生。”
遗憾的是,海绵样品的采集并不总是实用的,例如当它们位于深水中时。为此,研究人员正在研究从其他水过滤生物中收集eDNA,如水母或鲑鱼。
关于该研究的论文最近发表在《Current Biology》期刊上。
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