AI正帮助科学家发现新病毒 彻底改变病毒角色
导读:病毒就在我们身边,而我们目前还没有将这些庞大而多样化的生物进行分类。那些只能在活体宿主体内生存的微小生物,会对我们的身体造成巨大破坏,但这并不是研究人员被它们所吸引的唯一原因。
据Futurism报道,病毒就在我们身边,而我们目前还没有将这些庞大而多样化的生物进行分类。那些只能在活体宿主体内生存的微小生物,会对我们的身体造成巨大破坏,但这并不是研究人员被它们所吸引的唯一原因。我们现在知道,病毒可以在“非病毒性疾病”中扮演重要角色,比如肝硬化、慢性疲劳综合症甚至炎症性肠病,但我们仍然不理解原因。
为了找到原因,我们需要机器学习技术帮助。由于病毒不能在实验室中生长,科学家们传统上通过取样各种不同的环境(包括地铁车厢和下水道系统)来寻找新物种。但是从泥土中提取单个微生物是个缓慢的过程,这使得研究人员很难理解快速进化的病毒行为。这就是人工智能(AI)介入的原因。
机器学习是一种用于识别复杂模式的AI,这种算法通过一组数据进行训练,然后变得自主,并可用于扫描大量基因组数据集以寻找新的病毒。举例来说,巴西圣保罗大学生物信息学家戴维·阿姆加藤(Deyvid Amgarten)用机器学习识别隐藏在城市动物园堆肥里的病毒基因组。他称正利用自己的发现来了解病毒如何帮助分解有机物,以使堆肥更有效。
阿姆加藤的灵感来自于任杰(Jie Ren)开发的工具。任杰是南加州大学的计算生物学家,他使用算法来检查和比较肝硬化患者和健康人的粪便样本。任杰的研究小组发现,有些病毒在健康人群中比在肝硬化患者中更常见,这是某种病毒可以在疾病中发挥作用的线索。
任杰等人的研究结果让科学家们怀疑,病毒是否也能影响诸如慢性疲劳综合症和炎症性肠病等难以治愈的疾病。据估计,仅在美国就有大约300万成年人受到这些疾病的影响。康涅狄格州法明顿的杰克逊基因医学实验室免疫学家尤努马兹(Derya Unutmaz)对这些推测进行了回应,他观察到病毒可能是炎症反应的来源,这些反应可能会损害我们的新陈代谢和免疫系统。
从在非病毒性疾病中识别病毒的作用,到匹配病毒与特定细菌家族的耐药性,AI可能会彻底改变微生物在人类生活中扮演的角色。